燃石医学拥有高通量测序医学检验所执业资质 （包括医学检验所执业执照医学检验所年度质量体系运营审核校验证书、 临床基因扩增检测实验室资质等）；

位于中国广州的实验室获得了广东省卫健委临检中心颁发的“高通量测序实验室”技术审核，以及美国CLIA、CAP及ISO15189实验室质量体系资质认证；位于美国加利福尼亚州的实验室也已获得CLIA和CAP实验室质量体系资质认证。

截至2022年6月，燃石医学通过了超200次国内外权威机构组织的高通量测序检测室间质评，包括NCCL、PQCC、EMQN、CAP等。